Acentuação de nomes de arquivos no linux

Amigos, quando crio arquivos no Windows e os salvo no servidor Linux, os caracteres particulares de nossa língua, tais como ç, â, ã, é, etc.... são substituídos por quadrados e caracteres estranhos.

No entanto, se eu digitar algum desses caracteres (ç, â, ã, é) diretamente no servidor, eles são aceitos!

Apenas estou achando documentação a respeito de configurar diretamente a máquina Linux, ou seja, os documentos criados diretamente nela.

Como resolver? Alguém conseguiu?

Obrigado!