Erro em aplicações ao inicializar servidor (win 2003)

Fala pessoal!

Não tenho muita experiência com servidores Windows e creio que somente a experiência alheia pode ajudar.

Num servidor Windows 2003, tenho um conjunto de scripts que ficam rodando de tempos em tempos ou toda vez que o servidor é incializado (tudo via o scheduler do windows).

Estes scripts chamam alguns programas de linha de comando (blat, grep, sed e 7z). O caso é que, apesar do funcionamento aparentemente correto (peguei para trabalhar nele faz poucos dias e não fiz uma análise mais profunda, mas em suma funciona) toda vez que um usuário loga, aparecem aquelas mensagens de que a "ferramenta encontrou um erro e precisa ser finalizada".

Pelo google não consegui chegar a nenhuma conclusão pois isto ocorre por uma grande gama de problemas. Meu intuito é que vocês possam me fornecer dicas e fazer as perguntas corretas para tentar mapear o que está ocorrendo.

Muito obrigado!