Instalar o Sistema Operacional no SSD mais rápido deixa o computador mais rápido durante o uso?

Bom dia, 
Estou fazendo um dual boot de Windows 11 + Arch Linux na minha máquina. 
Tenho um SSD NVME M.2 de 500 gb e um SSD Sata de 128 GB. Obviamente o M.2 tem uma velocidade de gravação e armazenamento muito mais que o SATA.
Primeiramente eu dividi o SSD de 128 GB em 2 e instalei os 2 sistemas com 64 GB de memória, usando o SSD de 500 GB para armazenamento.
Gostaria de saber se eu instalar os Sistemas Operacionais em partições do SSD M.2, o sistema ficaria mais rápido durante todo o uso ou apenas na inicialização.
Se eu transferir algum arquivo do SSD Sata para o M.2, ou usar um programa instalado em outro SSD, essa operação ficaria com a velocidade do SSD mais limitado?

Também tive muitos problemas tendo o sistema operacional bootado em uma memória com pouco espaço.
Por exemplo, se eu quisesse descompactar um arquivo de 15 GB do SSD que eu uso para armazenamento para a mesma pasta, e meu SSD do Sistema Operacional esteja com apenas 10 GB de espaço, mesmo que tenha espaço o suficiente no SSD em que o arquivo está compactado, essa operação dá erro por falta de espaço.

Aí resta a dúvida, na minha situação, em qual das unidades de armazenamento fazer o Dual Boot? Como dividir as partições para não ter esse problema do espaço? O que explica esse fenômeno?

Desde já agradeço.