Windows 2000 Server

Galera o problema é o seguinte: Na empresa a qual trabalho posuui um sistema de contabilidade o qual foi desenvolvido em Clipper, tendo eu que mudar a plataforma operacional do servidor resolvir instalar o Windows 2000 Server utulisando o sistema de arquivos NTFS, pergunta: sendo o sistema de contabilidade tendo sido desenvolvido em clipper linguagem própria para rodar em ambiente DOS o qual utilisa o sistema de arquivos FAT 32 há possibilidade deste sistema rodar sem problemas no 2000 Server instalado em NTFS???Os responsáveis pelo sistema afirmam que o sistema roda nos windows 98,98se,Me,2000...só que não especificaram se ele roda no 2000 utilisando NTFS ou se roda no 2000 só que utilisando FAT32. Galera eu peço a vcs que me ajudem porque um imbecil que fornece suporte a este sistema que está me enchendo o saco afirmando que o problema é com o Windows 2000 Server que não presta...como é que uma pessoa estúpida dessa pode afirmar com tanta certeza que o problema é com o Windows e não com o sistema dele. E aí galera o que vcs me dizem a respeito desta afirmação criminosa em relação a um sistema tão robusto quando o Windows 2000 Server. :x