Reparei o windows e sumiram as pastas e arquivos

ao efetuar a reparação do windows ele me perguntou se eu queria subistituir a pasta do sistema, eu falei que sim. Quando a maquina terminou o processo todos os arquivos e pastas sumiram. alguem pode ma ajudar...

até onde eu sei a reparação não deveria ter apagado os arquivos da maquina. ela esta sem os office o anti-virus nada.
Durante o processo não chegou a pedir para formatar nada em nenhum momento.