Quem usa o Wine regularmente, acaba tendo a impressão de que, embora muitos aplicativos não rodem ou fiquem muito lentos, alguns aplicativos rodam com um desempenho melhor do que no Windows.
Esta série de benchmarks publicada no winehq traz alguma base científica para isso, comparando o desempenho de vários aplicativos, rodando sob o Wine e sob o Windows XP, no mesmo hardware.
http://wiki.winehq.org/BenchMark-0.9.5
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