MKV desmontado mas ainda não passa no Virtualdub Mod

Tenho um vídeo MKV que contém além do filme dois audio e duas legendas. Usei o MKVextract GUI e apareceu o MPEG-4/ISO/AVC mas quando aparece na pasta que salvei está escrito H264. Li alguma coisa a respeito e parece que é para Ipod algo como QuickTime. Então baixei o QuickTime e nada de vizualiar, não tenho muita certeza disso que disse. Também na mesma pasta que salvei tinha um audio AC-3 e um AGG-Vorbis e dois de texto escrito (S_TEXT/UTF8) e (S_VOBSUB). Sempre que tentava usar o VirtualdubMod apresentava uma mensagem de erro: Only handle [S_TEXT/] subs for the moments, isso parecia que era causado pelas legendas. Depois que consegui o MKVextract GUI achei que separando esses arquivos meus problemas acabariam, mas como disse acima ainda não pois esse H264 também não é detectado pelo VirtualdubMod e também quanto tento montar tudo menos as legendas o MKVmerge GUI diz que não consegue. Apenas os arquivos de audio AC-3 e Vorbis e se quizer a legenda. Usei um programa que converte MKV para outro container que quizer, e posso tirar o audio e converter para Avi XviD por exemplo, mas ainda consigo não com esse H264 depois de desmontado pelo MKVextract GUI.